കോശങ്ങൾ ഉയർന്ന ഓക്സിജൻ സാന്ദ്രതയിലേക്ക് നേരിട്ട് സമ്പർക്കം പുലർത്തുന്ന ഉപരിതല സംസ്ക്കരണത്തിൽ നിന്ന് ഷേക്ക്-ഫ്ലാസ്ക് കൾച്ചറിംഗ് വ്യത്യസ്തമാണ്. ഷേക്ക്-ഫ്ലാസ്ക് കൾച്ചറുകളിൽ, കൾച്ചർ ചാറിൽ സൂക്ഷ്മാണുക്കൾ സസ്പെൻഡ് ചെയ്യപ്പെടുന്നതിനാൽ കോശങ്ങൾ കുറഞ്ഞ ഓക്സിജൻ സാന്ദ്രതയ്ക്ക് വിധേയമാകുന്നു.